Los primeros doce equipos ubicados en la tabla de posiciones final de la presente edición de la B Nacional ganarán automáticamente un lugar en los 32avos. de la Copa Argentina 2017.
Independiente Rivadavia, que actualmente ocupa el puesto 17 en la tabla de posiciones, se quedó afuera de la presente edición de la Copa por la pobre campaña realizada en la última B Nacional. La Lepra buscará volver.